Scaffold Information

Sample ID 3300005985
Scaffold Ga0081539_10000003
Sample Name Tabebuia heterophylla rhizosphere microbial communities from the University of Puerto Rico - S4T2R2
Length 594833
Fam Num 154
Taxonomy Bacteria
Environment Rhizosphere
Lineage Bacteria;Pseudomonadota;Alphaproteobacteria;Hyphomicrobiales;Nitrobacteraceae;Bradyrhizobium;Bradyrhizobium sp. 200

CRISPR Details

Start Coordinate: 393723 End Coordinate: 393847
Position Repeat Spacer
393723 GTGGTGTTGCCGGCGCCGTTGA TGGTGGCGGTGGCGCCCCAGCCGGCCGTG
393774 GTGGTGTCGCCGGTGCCGTTGA TCCACAGCGACACCACGTTGGCGGCTGTC
393825 GAGGTGTTGTAGTTGCCGTTGA -

PFAM Info

PFAM Domain Meaning GOTerms

Scaffold Families

F208971 , F318241 , F320287 , F342995 , F345567 , F353545 , F358446 , F364547 , F387690 , F389341 , F392716 , F397534 , F401648 , F401858 , F403589 , F407982 , F411966 , F412376 , F412634 , F414870 , F416588 , F419754 , F423396 , F428219 , F439377 , F441525 , F441570 , F444170 , F444744 , F446467 , F447261 , F450227 , F453266 , F455483 , F455514 , F456370 , F457383 , F460044 , F461651 , F463153 , F464552 , F465133 , F465304 , F465861 , F466974 , F467143 , F467441 , F467855 , F467985 , F468599 , F469200 , F470979 , F470982 , F471172 , F471510 , F472515 , F473012 , F473393 , F473967 , F474575 , F474657 , F474663 , F475692 , F476076 , F476438 , F476515 , F476968 , F477033 , F477176 , F477393 , F478075 , F478521 , F479502 , F480415 , F480588 , F480892 , F481060 , F481103 , F481238 , F481527 , F481917 , F482409 , F482444 , F482663 , F483049 , F483522 , F483544 , F484138 , F484178 , F484609 , F484966 , F484970 , F485462 , F485569 , F485766 , F485960 , F486142 , F486541 , F486624 , F486808 , F487107 , F487186 , F487957 , F488086 , F489313 , F490173 , F490335 , F490458 , F490694 , F490878 , F491147 , F491169 , F491261 , F491364 , F491660 , F491744 , F491894 , F492114 , F492304 , F492837 , F493040 , F493046 , F493272 , F493360 , F494310 , F494610 , F494635 , F494916 , F494977 , F495033 , F495037 , F495107 , F495257 , F495720 , F495753 , F495781 , F495783 , F495794 , F495830 , F495983 , F496025 , F496480 , F496704 , F496737 , F496829 , F496854 , F496887 , F496893 , F496907 , F496921 , F497086 , F497120 , F497262 , F497418